Therese Frösch hat ihr Amt 2005 als Nachfolgerin von Cécile Bühlmann angetreten. Sie übernahm damals eine 14 köpfige Fraktion. Völlig verändert war die Situation nach den nationalen Wahlen 2007. Mit 20 Sitzen im Nationalrat, 2 Ständeratssitzen sowie der CSP-Vertretung und dem PdA-Sitz wuchs die Fraktion auf 24 Personen. Seit den Wahlen 2007 funktioniert auch die Grüne Fraktion neu mit einem Fraktionsausschuss und mit DelegationsleiterInnen für die grünen Dreierdelegationen in den Kommissionen. Nachdem Therese Frösch als Nachfolgerin von Hugo Fasel Mitglied der Geschäftsprüfungsdelegation (GPDel) geworden ist, hat sie beschlossen, das Amt als Fraktionspräsidentin nach fast vier Jahren zur Verfügung zu stellen. Ihre Nachfolge wird die Fraktion an der Fraktionssitzung vom 17. März bestimmen.

Nach neun Jahren Amtszeit hat der Generalsekretär, Hubert Zurkinden, seinen Rücktritt auf Ende August 2009 bekannt gegeben. Der 54 jährige tritt zurück, um nochmals eine neue berufliche Herausforderung anzunehmen. Zurkinden wurde im Dezember 1999 zum Generalsekretär gewählt und trat sein Amt im Mai 2000 an. In seiner Amtszeit sind die Grünen von einer Fünf- zu einer Zehnprozent-Partei geworden und haben sich in allen Kantonen etabliert. Und mit dem Beitritt der grün-alternativen Gruppen ist die grüne Partei auch inhaltlich breiter geworden. Gefördert und unterstützt hat Zurkinden die Gründung der jungen grünen, die heute in 17 Kantonen präsent sind. Stark vergrössert hat sich das Parteisekretariat. Von vier Personen im Jahr 2000 (insgesamt 190 Stellenprozente) ist das Sekretariat auf heute 7 Personen gewachsen (500 %).

Mit 9 Jahren ist Zurkinden der bisher am längsten amtierende Generalsekretär der Grünen. Vor ihm waren Bernhard Pulver (1988-1995) und Felix Wirz (1995-1999) Generalsekretäre der Partei. Über die Nachfolge von Zurkinden wird der Parteivorstand voraussichtlich Mitte Mai befinden.